Eurofins MWG Operon bietet die komplette oder vergleichende Sequenzierung von unbekannten Bakterien- oder Pilzgenomen und Metagenomen.

Nach Generierung der Rohdaten mit der neusten Genome Sequencer™ FLX Titanium Technologie, bieten wir die Zusammensetzung der einzelnen Contigs und das Schließen von Lücken mit Hilfe der Sanger Technologie an. Vergleichende Sequenzierung in Verbindung mit unseren bioinformatischen Dienstleistungen erlaubt es Ihnen, Ihren Zielstamm mit bereits bekannten Genomen abzugleichen.

• Sequenzierung prokaryotischer und eukaryotischer Genome jeder Größe
• Identifizierung von neuen, bisher noch nicht sequenzierten, Organismen
• Entschlüsselung von Metagenomen
• Vergleich von Wildtyp- und Mutantenstämmen
• Daten für „Metabolic Engineering“ und viele andere Anwendungsmöglichkeiten
• Stufenweiser Aufbau Ihres Projekts in gemeinsamer Zusammenarbeit
  
  Phase I
  Ultrahochdurchsatz Sequenzierung durch den GS FLX mit einer 15 bis 20-fachen Sequenzabdeckung; automatisches Assemblieren der Daten
  
  Phase II
  Anordnung der Contigs mittels Paired End-Sequenzierung mit dem GS FLX oder alternativ über Endsequenzierung einer Klonbibliothek mit großen Inserts mittels Sanger Technologie und anschließendem Co-Assembly der Daten
  
  Phase III
  Schließen von Lücken, entweder mit Hilfe von Primerdesign und Sequenzierung mittels Primer Walking auf ausgewählten Klonen oder über die Sequenzierung von PCR-Produkten aus der genomischen DNA
  
  Phase IV
  Bioinformatorische Analysen wie z. B. Annotation oder Stamm-Vergleiche.

• Ultrahochdurchsatz von bis zu 1 Million Sequenzen in weniger als 10 Stunden mit Leselängen von 350-450 Basen
• Für Genome Sequencer FLX-Sequenzierungen sind keine Klonierungen notwendig
  (Klonierungsfehler, insbesondere in AT-reichen Regionen, werden vermieden: sehr gleichmäßige Sequenzverteilung über das komplette Genom; keine Probleme mit pathogenen Organismen oder biologischer Sicherheit)
• Alternative Chemie im Vergleich zur Sanger Technologie
  kein kompletter Abbruch in GC-reichen Regionen
• Kostengünstige Re-Sequenzierungsmethode von Produktionsstämmen
• Re-Sequenzierung als Alternative zu anderen Screening-Methoden.